력사를 찾아서

환기9217해,신시배달5917해 단기 4353해,서기 2020해, 대한민국 101해(나뉨 72해),

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환국시대/유전학 [스크랩]<한국 가덕도 장항유적 출토 인골의 DNA분석> 소개 및 해설-2

동아 상염색체 <한국 가덕도 장항유적 출토 인골의 DNA분석> 소개 및 해설-2 초재 추천 3조회 508 20.02.18 08:29 댓글 18 2) f3 statistics 분석 F(A; B, C) = ((a-b)(a-c)) Outgroup F3 statistics는 유전적 거리를 측정하려는 두 집단(B, C)과 유전적 관계가 없는 것이 확실한 Outgroup A으로부터, 유전적 관계가 있는 것으로 추측되는 두 집단이 얼마 정도 가깝고, 먼 지를 수치로 나타내어 알 수 있게 하는 기법입니다. 좀 더 정확히는 여기서의 유전적 거리(genetic distance)는 조작적으로 정의해서, 두 집단간에 공유하는 대립형질 빈도(Allele Frequency)의 차이, 즉, 진화적으로 얼마나 많이 유전적표변(Gen..

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환국시대/유전학 [스크랩]<한국 가덕도 장항유적 출토 인골의 DNA 분석>소개 및 해설-1

동아 상염색체 <한국 가덕도 장항유적 출토 인골의 DNA 분석>소개 및 해설-1 초재 추천 2조회 319 20.02.18 08:07 댓글 15 한반도의 토양이 대부분 강한 산성을 띠고 있기에, 오래된 인골이 그대로 유전자정보를 가지고 남아 있기 보다는 빠르게 부식되어 버리기에, 연구에 적합한 남아 있는 고인골의 수가 매우 적고, 한국에서 분자인류학 연구에 대한 인식이나 지원도 낮고, 국내 연구자들의 고인골 DNA 추출이나 분석기술 수준도 미흡한 면이 있기에, 이제까지 제대로 고인골에 대한 분자인류학적 연구가 이루어진 것이 적었습니다. 그나마 이루어진 적은 수의 고인골에 분자인류학적 연구는 그 고인골의 부계를 확인할 수 있는 Y염색체 하플로그룹나 모계 계통을 알 수 있는 미토콘드리아 DNA 하플로그룹 의 ..

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환국시대/유전학 [스크랩]고인골 게놈 데이타로 알아 보는 한국인의 기원-6

동아 상염색체 고인골 게놈 데이타로 알아 보는 한국인의 기원-6 초재 추천 3조회 528 20.07.17 07:30 댓글 13 4. F-statistics 다음은 한국인을 포함하는 몇 개의 D-statistics의 결과를 가지고, 그 의미를 분석해 보기로 한다. (그림 18) D-stat (Korean,Chinese-Han, Ancient East-Asians, Mbuti) 위의 D-statistics 그래프는 한국인과 중국 한족이, 선사시대의 여러 동아시아 고인골들과 어떤 관계를 가지는 지 비교하는 것으로서, 오른쪽에 0 보다 큰 값이 나온 샘플들은 중국 한족보다 한국인과 보다 많은 유전자를 공유하거나, 혹은 한국인과 보다 많이 혼혈이 되었다고 해석할 수 있다. 반면, 왼쪽의 0보다 적은 값이 나오는 ..

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환국시대/유전학 [스크랩]고인골 게놈 데이타로 알아 보는 한국인의 기원-5

동아 상염색체 고인골 게놈 데이타로 알아 보는 한국인의 기원-5 초재 추천 5조회 310 20.07.16 07:41 댓글 4 5) 동아시아 남방 고인골의 Admixture (그림14) 동아시아 남방샘플들의 Admixture K=3 (그림15) 동아시아 남방샘플들의 Admixture K=7 동아시아 남방 샘플들의 K=3과 K=7 Admixture 결과를 표시한 그래프에 43000년 전 북경 부근의 Tianyuan 동굴에서 발견된 샘플의 결과도 같이 표시했다. 그 이유는 라오스의 Hoabinhian 샘플과 같이, 동아시아 남방에서 다른 고인골 샘플보다 더 시기가 오래된 샘플이 더 후대의 대만 철기시대 Hanben문화로 대표되는 남방성분 및 황하유역 동아시아 내륙 북방성분, 그리고, 카자흐스탄의 Botai문화..

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환국시대/유전학 [스크랩]고인골 게놈 데이타로 알아 보는 한국인의 기원-4

동아 상염색체 고인골 게놈 데이타로 알아 보는 한국인의 기원-4 초재추천 3조회 266 20.07.15 07:58댓글 1) 요하유역 내몽골지역에 위치한 유민문화에서 나온 샘플은 요하유역 문화는 아니지만, 다른 지역보다 요하유역 샘플들과 유전적 구성이 유사하므로, 이번 요하유역 샘플과 같이 넣어서, 분석하기로 한다. (그림9) 요하유역 Admixture (K=3) (그림 10) 요하유역 Admixture (K=7) 요하유역 샘플 가운데, 유민문화, 합민망합문화, 하가점상층문화의 Outlier가 북방성분이 많고, 반대로, 하가점하층문화의 이도정자유적에서 나온 샘플들이 남방성분이 많다. 이도정자유적에서 나온 샘플은 PCA도면에서도 황하유역 샘플들과 거의 같은 위치에 있고, Admixture K=7에서도 황하유..

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환국시대/유전학 [스크랩]고인골 게놈 데이타로 알아 보는 한국인의 기원-3

동아 상염색체 고인골 게놈 데이타로 알아 보는 한국인의 기원-3 초재추천 3조회 351 20.07.15 07:25댓글 3.1. Admixture 분석 각 인구집단의 유전자 구성성분을 분석하여 보여주는 Admixture 분석은 Unsupervised mode에서 실행한 K=3, K=7 두개의 결과를 5개 지역별로 나누어서, 보여 주기로 한다. Admixture분석에 사용된 샘플들은 Plink 프로그램으로 MAF 0.05, Geno 0.1으로 필터링하고, LD pruning은 200,25,0.4로 하였다. 1) 연해주지역 (그림5)연해주지역Admixture K=3 (그림6)연해주지역Admixture K=7 연해주지역 샘플 중에 Devils_Cave의 샘플들이 년대가 가장 이른 B.C. 5600년 경의 루드나..

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환국시대/유전학 [스크랩]고인골 게놈 데이타로 알아 보는 한국인의 기원-2

동아 상염색체 고인골 게놈 데이타로 알아 보는 한국인의 기원-2 초재추천 4조회 262 20.07.15 07:17댓글 2. PCA 그래프 동아시아 선사시대인과 현대인구집단의 PCA그래프 이번에는 동아시아지역의 선사시대인과 현대 인구집단의 샘플들이 같이 나오는 PCA 그래프를 통해서, 이들간의 유전적 거리를 알아보고, 그 함의를 분석해보기로 한다. PCA 그래프는 각 샘플들의 상염색체 대개 3~6개 정도 구성성분으로 나누고, 그 중에서 가장 중요한 2개의 성분을 X,Y 축으로 표시하여 나타낸다. 위의 PCA 그래프를 보면, M_East(몽골고원 동부 신석기인)과 같이, 북방성분이 많을수록 왼쪽에 위치하고, 대만의 Austronesian어를 사용하는 원주민인 Atayal과 같이 남방성분이 많으면 오른쪽에 위..

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환국시대/유전학 [스크랩]고인골 게놈 데이타로 알아 보는 한국인의 기원-1

동아 상염색체 고인골 게놈 데이타로 알아 보는 한국인의 기원-1 초재 추천 3조회 745 20.07.15 07:14댓글 3 이 글은 최근에 나온 동아시아인에 대한 세 논문, Wang et al. 2020, Yang et al. 2020, Ning et al. 2020에 나온 내용과 고인골 유전자 자료 및, 이전에 나온 여러 논문에 나온 자료들을 광범위하게 정리한 하버드대학 데이비드 라이히 연구팀의 HumanOrigin Dataset에 나온 자료들을 바탕으로, 동북아시아인 특히, 한국인의 형성에 대한 분자인류학적 해석을 시도한 것이다. 아직, 동아시아 지역의 고인골 DNA자료가 충분하지 않기 때문에, 부득이하게 고인골 자료에 근거하지 않은 추정도 포함되어 있기에, 향후, 더 많은 자료들이 나오면, 이를 보..